Если необходимо зачесть долг по одному договору и предоплату по другому, воспользуйтесь корректировкой взаиморасчетов
(документы - акты сверки, долги).
В одной строке добавляем клиента и тот договор, по которому мы должны контрагенту и сумму зачета с плюсом.
В другой - клиента и договор, по которому он должен нашей компании и сумму с минусом.
Воспользуйтесь кнопкой «расчеты» над списком контрагентов.
Откройте отчеты - взаиморасчеты - расчеты с клиентами. Выберите группировку «контрагент» и установите фильтр с помощью кнопки «…» или кнопки с лупой. Подробнее об установке фильтра
В списке контрагентов нажать действия - платежи, расчеты - создать акт сверки.
Подробнее об акте сверки
Воспользуйтесь обработкой «служебные - создать документ ввода остатков,
обнуляющий остатки регистра/регистров».
Подробнее